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Dieses Lehrbuch bildet eine Brücke von der Biologie zur Bioinformatik. Die Methoden für die Erstellung klassischer Stammbäume werden zunächst resümiert, bevor DNA- und Protein-Sequenzen als digitalisierbare Merkmale den Übergang zu den Prinzipien der Bioinformatik ermöglichen. Der Vergleich von Sequenzen in Alignments bildet die Grundlage für molekulare Homologien, ermöglicht die Sequenzsuche in Datenbanken und erlaubt die Ableitung von molekularen Phylogenien. Die wesentlichen Prinzipien für moderne Anwendungen der Bioinformatik, wie Methoden von Transcriptomics und die Vorhersage von Protein-Strukturen, finden sich im letzten Kapitel. Aufgaben und ihre Lösungen ermuntern zur Anwendung der BIOinformatik und motivieren zu eigenen Fragestellungen.
Inhaltsverzeichnis
Teil I - Klassische Taxonomie und Molekulare Biologie.- Fundament der Bioinformatik: Klassischen Systematik und Phylogenie.- Fundament der Bioinformatik: DNA und Proteine.- Teil II - Prinzipien der Bioinformatik.- Information für die Bioinformatik.- Molekulare Homologie, die Basis der Bioinformatik.- Alignment, das Werkzeug zur Untersuchung von molekularen Homologien.- Durchführung molekular-phylogenetischer Analysen.- Moderne Anwendungen der Bioinformatik.- Anhang.
Über den Autor / die Autorin
Horst D. Lohrer
ist nebenberuflicher Dozent an der Hochschule Albstadt-Sigmaringen in der Fakultät Life Sciences und unterrichtet in den Fächern Biologie und Molekulare Biologie. Nach seinem Chemie- und Biologie-Studium in München und Karlsruhe promovierte er am Institut für Genetik der Universität Karlsruhe über die Resistenz von Zellen gegenüber Chemotherapeutika. Die Forschungsinteressen erweiterten sich auf DNA-Reparatur und Tumorgenese am Cancer Research Institute der University of Newcastle upon Tyne, dem Cancer Research Gray Laboratory in Northwood / London und dem Helmholtz Zentrum in München. Bis 2020 arbeitete Horst Lohrer als Lehrer am Gymnasium in Gammertingen, Baden-Württemberg.
Zusammenfassung
Dieses Lehrbuch bildet eine Brücke von der Biologie zur Bioinformatik. Die Methoden für die Erstellung klassischer Stammbäume werden zunächst resümiert, bevor DNA- und Protein-Sequenzen als digitalisierbare Merkmale den Übergang zu den Prinzipien der Bioinformatik ermöglichen. Der Vergleich von Sequenzen in
Alignments
bildet die Grundlage für molekulare Homologien, ermöglicht die Sequenzsuche in Datenbanken und erlaubt die Ableitung von molekularen Phylogenien. Die wesentlichen Prinzipien für moderne Anwendungen der Bioinformatik, wie Methoden von
Transcriptomics
und die Vorhersage von Protein-Strukturen, finden sich im letzten Kapitel. Aufgaben und ihre Lösungen ermuntern zur Anwendung der BIOinformatik und motivieren zu eigenen Fragestellungen.
