Gene und Stammbäume - Ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik

Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - sie üben Faszination aus, halten aber viele Interessierte auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue Einsichten geliefert.
Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - war nicht unbedingt einfach. Hier schloss "Gene und Stammbäume" 2006 eine Lücke. Die zweite Auflage behält das bewährte Konzept bei, ist aber inhaltlich um zwei Kapitel erweitert, die den neuesten Trends unter anderem bei Bayesianischen Ansätzen Rechnung tragen.
Einführende Kapitel über Molekularbiologie, Evolution, Taxonomie und Kladistik ermöglichen je nach Wissenshintergrund einen leichten Zugang zur Molekularen Phylogenetik. Den besonders schnellen Einstieg erlaubt ein spezielles Kapitel über den Weg von der Sequenz zum Stammbaum ohne Umwege oder Details. Wer es genauer wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Maximum Likelihood und Bayesianische Verfahren. Speziellere Kapitel widmen sich neuen Methoden für stammbaumbasierte statistische Tests, Supertrees, Analysen von Substitutionsraten, molekularer Datierung und vielem mehr. Alles wird hands on anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann.
Das Buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Endeder Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.

Sommario

Die molekularen Grundlagen des Lebens.- Evolution, Taxonomie, Kladistik und Phylogenetik.- Datenbanken, Alignments, Software.- Stammbäume rekonstruieren: das Allerwichtigste in einem Kapitel.- Parsimonieanalyse.- Distanzverfahren.- Maximum Likelihood.- Bayesianische Statistik.- Raten und Zeiten.- Testen und Vergleichen: Modelle, Bäume und Methoden.- Viele Loci, viele Taxa, viele Bäume.- Molekulare Einsichten zu alten und neuen Kladen.

Info autore

Prof. Dr. Volker Knoop, geb. 1963, hat in Berlin Biochemie studiert und dort am Institut für Genbiologische Forschung und später an der Universität Ulm gearbeitet. Er ist seit 2002 Leiter der Abteilung Molekulare Evolution an der Universität Bonn und Gründungsdirektor des dortigen IZMB, des Instituts für zelluläre und molekulare Botanik. Seine wissenschaftlichen Interessensgebiete sind die Besonderheiten in der mitochondrialen DNA der Pflanzen und die Stammesgeschichte der frühesten Landpflanzen.

Dr. Kai Müller, geb. 1975, war wissenschaftlicher Mitarbeiter am Nees-Institut für Biodiversität der Pflanzen der Universität Bonn und arbeitet zurzeit am Department of Biology der Penn State University. Zu seinen Forschungsschwerpunkten gehören die Stammesgeschichte diverser Blütenpflanzengruppen, die Evolution nicht-proteinkodierender DNA-Regionen, und bioinformatische Fragestellungen, einschließlich der Entwicklung von Methoden und Programmen.

Riassunto

Gene, Genome und Sequenzen auf der einen, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen gehören zur Molekularen Phylogenetik, einer spannende Teildisziplin der Bioinformatik. Deren Ziel ist die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten.

Rasch wurde eine 2. Auflage dieses Praxisbuches erforderlich. Kapitel über Molekularbiologie, Evolution, Taxonomie und Kladistik ermöglichen einen leichten Zugang. Es folgen detaillierte Einführungen in die Methoden: Parsimonie, Distanzverfahren, Maximum Likelihood und Bayesianische Verfahren. Alles wird anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit gängiger Software beschrieben.

Testo aggiuntivo

Herrlich wie Knoop und Müller den trockenen Stoff der molekularen Phylogenetik in einfacher, unprätentiöser und humorvoller Rede pädagogisch aufbereitet haben: Viel besser kann man das nicht darstellen. (...) Ein bemerkenswertes, ein empfehlenswertes Buch.
Laborjournal, Oktober 2010
Das buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.
www.literatur-report.de, November 2008
Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will dieses Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC, das Internet und dieses Buch. Lebensmittel & Biotechnologie
V. Knoop und K. Müller haben ein hervorragendes Einsteigerhandbuch mit sehr viel Engagement und didaktischem Können produziert, das alle wichtigen Themen berücksichtigt und das man gerne lesen mag. Es gibt einen kompetenten Überblick über die molekulare Systematik und Phylogenetik. Gene und Stammbäume sollte man allen ans Herz legen, die sich mit dieser wichtigen und zukunftsweisenden Materie wissenschafltich beschäftigen wollen.
Physik in unserer Zeit
(...) ein richtiges Arbeitsbuch, das für Studierende und jene mit Nachholbedarf in kompakten Portionen alles Wichtige bereitstellt. Es kann daher allen Interessierten empfohlen werden.
Chemiereport.at

Relazione

Herrlich wie Knoop und Müller den trockenen Stoff der molekularen Phylogenetik in einfacher, unprätentiöser und humorvoller Rede pädagogisch aufbereitet haben: Viel besser kann man das nicht darstellen. (...) Ein bemerkenswertes, ein empfehlenswertes Buch.
Laborjournal, Oktober 2010
Das buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.
www.literatur-report.de, November 2008
Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will dieses Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC, das Internet und dieses Buch. Lebensmittel & Biotechnologie
V. Knoop und K. Müller haben ein hervorragendes Einsteigerhandbuch mit sehr viel Engagement und didaktischem Können produziert, das alle wichtigen Themen berücksichtigt und das man gerne lesen mag. Es gibt einen kompetenten Überblick über die molekulare Systematik und Phylogenetik. Gene und Stammbäume sollte man allen ans Herz legen, die sich mit dieser wichtigen und zukunftsweisenden Materie wissenschafltich beschäftigen wollen.
Physik in unserer Zeit
(...) ein richtiges Arbeitsbuch, das für Studierende und jene mit Nachholbedarf in kompakten Portionen alles Wichtige bereitstellt. Es kann daher allen Interessierten empfohlen werden.
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Dettagli sul prodotto

• Autori: Volke Knoop, Volker Knoop, Kai Müller
• Editore: Springer Spektrum
• Lingue: Tedesco
• Formato: Tascabile
• Pubblicazione: 01.01.2008
• EAN: 9783827419835
• ISBN: 978-3-8274-1983-5
• Pagine: 386
• Dimensioni: 182 mm x 247 mm x 26 mm
• Peso: 802 g
• Illustrazioni: XI, 386 S. 130 Abb.
• Categorie: Scienze naturali, medicina, informatica, tecnica > Biologia > Microbiologia; A, Evolution, Genetik (nicht-medizinisch), molecular biology, bioinformatics, Zoology & animal sciences, Evolutionary Biology, Biomedical and Life Sciences, Botany & plant sciences, Information technology: general issues, Taxonomy & systematics, Plant Systematics/Taxonomy/Biogeography, Plant systematics, Plant Evolution, Plant taxonomy, Cell Biology, Genetics (non-medical), Plant Genetics, Plant Genetics and Genomics, Animal genetics, Agricultural Genetics, Animal Genetics and Genomics