Vergleich verschiedener Reaktionskoordinaten in MD-Simulationen anhand der Polypeptide Ala9, YQNPDGSQA und 1enh

Das Verständnis der Entfaltung von Proteinen ist trotz ausführlicher Experimente noch immer nicht vollständig möglich. Um dieses Defizit zu minimieren, können theoretische Ansätze wie die Moleküldynamik-Simulation (MD-Simulationen) genutzt werden, da dies tiefere Einblicke in den Prozess der Proteinfaltung ermöglicht. Im Rahmen dieser Arbeit werden anhand von Simulationen zweier verschiedener Peptide (Ala9 und YQNPDGSQA) und einem kleinen Protein (1enh) fünf sogenannte Reaktionskoordinaten miteinander verglichen und deren Eignung für zukünftige MD-Simulationen ermittelt.

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Einleitung.- Grundlagen.- Material und Methoden.- Ergebnisse und Diskussion.- Zusammenfassung und Ausblick.

About the author

Yannik Kasprzak hat seinen Master in Biophysik an der Universität zu Lübeck absolviert. Dort hat er unter der Leitung von PD Dr. Hauke Paulsen im Institut für Physik an Grundlagen der MD-Simulation geforscht.

Summary

Das Verständnis der Entfaltung von Proteinen ist trotz ausführlicher Experimente noch immer nicht vollständig möglich. Um dieses Defizit zu minimieren, können theoretische Ansätze wie die Moleküldynamik-Simulation (MD-Simulationen) genutzt werden, da dies tiefere Einblicke in den Prozess der Proteinfaltung ermöglicht. Im Rahmen dieser Arbeit werden anhand von Simulationen zweier verschiedener Peptide (Ala9 und YQNPDGSQA) und einem kleinen Protein (1enh) fünf sogenannte Reaktionskoordinaten miteinander verglichen und deren Eignung für zukünftige MD-Simulationen ermittelt.

Product details

• Authors: Yannik Kasprzak
• Publisher: Springer, Berlin
• Languages: German
• Product format: Paperback / Softback
• Released: 25.09.2025
• EAN: 9783658491390
• ISBN: 978-3-658-49139-0
• No. of pages: 107
• Dimensions: 148 mm x 7 mm x 210 mm
• Weight: 208 g
• Illustrations: XXVI, 107 S. 86 Abb.
• Series: BestMasters
• Subjects: Natural sciences, medicine, IT, technology > Physics, astronomy > Theoretical physics; Biophysik, Molekularbiologie, Proteine, Quanten- und theoretische Chemie, Theoretical, Mathematical and Computational Physics, Biophysics, molecular dynamics, Molecular Modelling, Moleküldynamik-Simulation, MD-Simulationen, Proteinfaltung