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La red metabólica es una de las clases importantes de redes biológicas, que consiste en reacciones enzimáticas que implican sustratos y productos. Los recientes desarrollos en las bases de datos de rutas nos permiten analizar las redes metabólicas conocidas. Sin embargo, la mayoría de las redes metabólicas específicas de los organismos se quedan con un número de reacciones enzimáticas desconocidas, es decir, faltan muchas enzimas en las vías metabólicas conocidas, y estas enzimas que faltan se definen como agujeros de las vías metabólicas, Aunque todas las reacciones en algunas vías se conocen, pero también estas vías tienen un agujero, el agujero en este caso significa que no conocemos los genes detrás de estas reacciones. El pilar del ciclo de investigación es la recogida de datos que precede a la fase de análisis para resolver el agujero de la vía. Los datos necesarios para esta área están dispersos entre diferentes fuentes de datos, lo que representa un problema para los investigadores de esta área. Esta tesis proporciona una solución a este obstáculo mediante la recopilación de los datos necesarios de varias fuentes de datos en una base de datos RGBMAPS; también hemos desarrollado una herramienta que podría ser utilizada por otros investigadores para analizar los agujeros de la vía.
About the author
B.Sc., Departamento de Informática, Faculdade de Engenharia. Mestrado do Departamento de Sistemas de Informação, Faculdade de Informática e Informação - Universidade de Helwan, Bioinformática. Doutoramento pelo Departamento de Informática, Faculdade de Informática e Informação - Universidade do Cairo, Bioinformática. Interesses de investigação: Bioinformática, aprendizagem profunda.
