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Les microorganismes associés aux deux races d'abeilles locales : A.m.intermissa et A.m.sahariensis ont été caractérisés. L'identification de la microflore associée au tube digestif et au pollen a été faite trois (03) fois durant l'année 2011 La recherche de cette microflore a été réalisée à partir du tube digestif, du pollen stockés (pain d'abeille) et du pollen des corbeilles des abeilles locales. Les bactéries isolées appartiennent aux genres :Enterobacter, Pantoae, Pseudomonas, Lactococcus (et aux genres voisions) Lactobacillus et Staphylococcus. Toutes les souches de levures sont susceptibles d'appartenir au genre Saccharomyces et les moisissures identifiées sont des genres : Penicillium, Aspergillus, Cladosporium, Mucor et Alternaria. D'après les caractères biochimiques et physiologiques trouvés, certaines bactéries peuvent être impliquées dans la dégradation des constituants des deux couches externes du pollen, être ingérées par l'abeille avec les aliments et transmises aux autres individus de la ruche par le phénomène de trophallaxie . La présence des levures et des moisissures peut s'expliquer par la relation étroite qu'entretien l'abeille avec son environnement.
